除肿瘤外，PET-CT在其他方面的应用也日益得到重视，心肌存活的研究已成为近年来的热门话题，普遍认为，PET心肌代谢显像的方法，是目前判断心肌细胞活性最准确的方法，称为“金标准”。PET显像可以帮助确定和鉴别坏死心肌与可逆性缺血心肌，对介入治疗、冠状动脉搭桥手术有重要的指导作用，可明显提高搭桥手术的成功率，同时可对术后心功能恢复情况进行预测。另外，脑代谢显像能准确了解正常情况下和疾病状态下的神经细胞活动及代谢变化，以及不同生理条件刺激和思维活动状态大脑皮质的代谢情况。通过PET可以直观地了解到人大脑代谢活动情况及各种生理性或病理性代谢变化，并以图像的方式反映出来。
虽然PET-CT有诸多优点，但同其他任何一种检查方法一样，PET-CT也有其不足，也会出现假阳性，如结核、炎症、感染、外伤、结节病、肉芽肿、寄生虫病和自身免疫疾病，治疗后改变如手术切口、穿刺、活检、放疗导致的组织增生和炎症、化疗后的骨髓增生等均表现为高代谢。另一方面，某些葡萄糖代谢增高不明显的低度恶性肿瘤，又有可能导致假阴性，如少部分高分化肝细胞癌、甲状腺癌、肾透明细胞癌、前列腺癌、胃印戒细胞癌及部分细支气管肺泡癌、类癌、神经内分泌瘤等。这就需要诊断医师结合各种影像资料和临床信息综合判断，较少误诊、漏诊。
人们在检查时最担心的便是PET-CT的辐射安全性，我们可以对比一下数据，一次胸部诊断CT剂量约5msv；一次全腹诊断CT约8～10msv；一次校正CT辐射剂量约2～3msv；注射一次放射性药物放射性辐射剂量：体重×0.8mci/kg÷2（以70kg体重为例，一次放射性剂量的辐射量约2.8msv）。一次PET-CT检查的辐射剂量略大于一次胸部诊断CT的剂量，其安全性毋庸置疑。
PET-CT的出现，使无创伤性的、动态的、定量评价活体组织或器官在生理状态下及疾病过程中细胞代谢活动的生理、生化改变，获得分子水平的信息成为可能，这是目前其他任何方法所无法实现的。卫生经济学分析表明，虽然PET-CT的检查费用昂贵，但只要掌握好适应症，正确使用，首选这种一步到位的检查方法对于很多肿瘤的诊断和分期比用传统的方法都经济，并且能够缩短确诊时间，在总体上也降低社会医疗成本。
