长链非编码RNA (Long noncoding RNAs， lncRNA)是一类无或少有蛋白质编码能力的复杂长链非编码RNA，其在多数真核生物基因组被转录。目前，人们对lncRNA的认识还处在初级阶段，最初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，lncRNA参与了X染色体沉默，基因组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。RNA不仅仅只承担遗传信息中间载体的辅助性角色，而是更多地承担了各种调控功能。ncRNA在发育和基因表达中发挥的复杂精确的调控功能极大地解释了基因组复杂性之难题，同时也为人们从基因表达调控网络的维度来认识生命体的复杂性开启新的天地。现在大部分研究集中于短 RNA如， microRNA，piRNA等一些 ncRNA 生物生成机制和调控通路，甚至在一些人类复杂疾病中的功能，但是这都只是冰山一角。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1%），虽然近年来关于lncRNA的研究进展迅猛，但是绝大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的，随着研究的推进，各类 lncRNA 的大量发现，lncRNA 的研究将是 RNA 基因组研究非常吸引人的一个方向，使人们逐渐认识到基因组存在人类知之甚少的“暗物质”。
lncRNA通常较长，具有mRNA样结构，经过剪接，具有polyA尾巴与启动子结构，分化过程中有动态的表达与不同的剪接方式。lncRNA启动子同样可以结合转录因子，如Oct3/4，Nanog，CREB，Sp1， c-myc，Sox2与p53，局部染色质组蛋白同样具有特征性的修饰方式与结构特征。大多数的lncRNA在组织分化发育过程中，都具有明显的时空表达特异性，如有人针对小鼠的1300个lncRNA进行研究，发现在脑组织中的不同部位，lncRNA具有不同的表达模式。在肿瘤与其他疾病中有特征性的表达方式。序列上保守性较低，只有约12%的lncRNA可在人类之外的其他生物中找到。
长链非编码RNA的作用机制非常复杂，至今尚未完全清楚。根据目前的研究，lncRNA的作用机制主要有以下几种：编码蛋白的基因上游启动子区转录，干扰下游基因的表达；抑制RNA聚合酶II或者介导染色质重构以及组蛋白修饰，影响下游基因的表达；与编码蛋白基因的转录本形成互补双链，干扰mRNA的剪切，形成不同的剪切形式；与编码蛋白基因的转录本形成互补双链，在Dicer酶的作用下产生内源性siRNA；与特定蛋白质结合，lncRNA转录本可调节相应蛋白的活性；作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体；结合到特定蛋白质上，改变该蛋白质的细胞定位；作为小分子RNA（如miRNA、piRNA）的前体分子。(沈小英 解放军第306医院病理科)
