在第二组核心实验中，研究人员首先用病毒感染了一个品系的小鼠，然后让被感染小鼠分别感染和它同一品系和不同品系的小鼠，之后采用和第一组实验相同的办法来评估仅仅经过两次传代，病毒的传播速度和致病性能否发生变化。
图片来源：论文原文
图示意思：病毒连续感染小鼠实验。
图中A、B、C和D分别代表了具有不同基因型的小鼠。PR为传播轮数编号。a:“五轮传播实验”；传播阶段：获得连续在“同基因型宿主”和“不同基因型宿主”中传播了五次的病毒。检测阶段：使用传播阶段所得病毒，感染多只A小鼠，以检测评估病毒的状态。b.“两轮传播实验”；传播阶段：获得在“同基因型宿主”和“不同基因型宿主”中传播了两次的病毒。检测阶段：使用传播阶段所得病毒，感染多只A小鼠以检测评估病毒的状态。
“我们发现，病毒在具有相同基因型的小鼠之间传播后，其复制的速度明显加快，并且其所导致的病情也会更严重，”库比纳克说。“但它在不同基因型小鼠间传播后，复制速度和毒力并没有增加。”
波茨认为，这个结果可以这么解释：弗兰德病毒复合体有一个处在不断快速突变中的小基因组，当其感染A小鼠后，它会产生适合感染A小鼠的突变。但如果现在它去感染B小鼠，那么这个本应该帮助它感染A小鼠的突变，可能无法在感染B小鼠中发挥作用，甚至会起到反作用。
研究人员目前正试图探明：病毒在适应不同基因型宿主时，其基因组中的哪些基因发生了改变。
