1959年在内科教研室隶属下设立消化专业组，1980年正式编制为消化内科，并设胃镜检查室。1984年、1986年先后批准为硕士、博士学位授权学科。初建时床位10余张，现开设41张。现有各类人员35名，其中高级职务人员6名。 历任主任：张国治（兼）、李石、陈仕葆、张贤康、张忠兵、谢渭芬。副主任：张兴荣、杨秀疆、陈岳祥。历任高级职务的还有副教授李桂生、钱淑贞、高若兰、蔡洪培。
该科是由内科界著名专家张国治、李石等教授创建的博士点。1961年开始胃镜检查，国内较早开展硬化剂注射，单环和多环套扎以及组织凝胶治疗肝硬化食管静脉曲张破裂出血，内镜下逆行胰胆管造影、乳头切开、胆胰管支架植入，特别是超声内镜下肿瘤穿刺诊治胆胰性疾病，已成为该科的医疗特色。在国内最早开展肉毒杆菌毒素局部注射和气囊扩张相结合治疗贲门失弛缓病200例，有效率达95%以上。
该科发明的多功能腹膜检查针，使原因不明腹水的临床病因诊断率提高到85%以上。该科在肝纤维化的发病机理、诊断和治疗等方面进行了大量探索研究，获得重要成果。积极开展慢性肝病及其并发症的临床诊治工作，对肝硬化腹水、食管曲张静脉破裂出血等并发症的诊治已形成特色。
2002年—2004年连续3年获集体三等功，2005年被评为总后勤部先进党支部、第二军医大学学习成才先进单位。
