1960年在创伤外科基础上组成专业组，隶属外科教研室，床位只有6张，1975年增至25张组建神经外科，1979年2月正式列编为神经外科，床位增至40张。1978年成为首批硕士学位授权学科和全军创伤外科中心主要单位。1981年批准为博士学位授权学科。1995年3月批准为“上海市神经外科研究所”，李家顺兼行政所长，朱诚为学术所长。副所长：卢亦成、张光霁、杨中坚、江基尧。1996年成为上海市医学领先专业重点学科。现开设床位75张，有各类人员65名，其中高级职务10名。
该科不断开拓，积极创新，研究的课题基本上函盖了神经外科临床及基础研究范围，并根据学科发展的最新进展，完成了多项前沿课题。特别是朱诚教授带领科技人员长期攻关，使颅脑损伤救治成为该科的突出特色，形成了一套合理和先进的严重颅脑损伤的临床救治体系，建立并完善了严重颅脑损伤患者的临床救治方案，临床救治的死亡率处于国内外最低水平。该科在颅脑肿瘤、脑血管病、脊髓肿瘤以及功能神经外科等方面均取得了显著的成绩。颅底肿瘤和脊髓内肿瘤的显微外科手术、血管内介入治疗脑血管病、栓塞治疗加显微外科手术治疗巨大动静脉畸形、超早期动脉内融栓治疗急性脑梗塞等已成为该科新的医疗特色。
该科获国家科技进步二等奖、军队科技进步二等奖以上19项，90年代以来发表论文340余篇，专著15部。1995年总后授予“基层建设标兵单位”称号，荣立集体二等功。担任全国、全军和上海市学术组织重要职务8个。
