以泌尿外科为基础组建全军器官移植中心于2011年升级成为全军细胞与器官移植研究所。现已开展的移植从肾、肝、胰等大器官移植，到胰岛细胞、干细胞移植及角膜移植，从单器官移植到多器官移植等十一大类型。形成了移植种类齐全、临床优势突出、影响辐射国内外的学科群。1977年开展首例尸体肾脏移植，至今累计肾移植3358例。中国肾移植科学登记系统资料显示：我院累计肾移植数量居全国首位，年移植量连续六年全国排名前三位。1982年开展肝移植，是国内最早开展肝移植的医院之一，至今累计肝移植558例。于2003年1月，率先在亚洲开展首例成人胰岛细胞肝内移植，获得成功。至今累计完成25例，数量居亚洲首位。2005年6月，成功开展亚洲首例成人胰岛细胞与肾脏联合移植，至今累计完成15例，数量居亚洲首位。肝-肾联合移植：31例，胰-肾联合移植：9例，亚洲首例肝-胰-肾联合移植，2007年开展世界首例肾脏-胰岛细胞-干细胞联合移植，2008年开展肾脏与干细胞联合移植：252例。
在国际上率先开展了7项干细胞移植治疗技术临床试验研究，分别在糖尿病、移植免疫、肾脏病、免疫性疾病和缺血性疾病等方面进行研究，建立了42个实验技术与临床方案SOP标准文件，培养了实验技术与临床试验的技术团队。获得总后卫生部首批干细胞临床研究技术准入资质。研究水平处于国际际领先地位。
移植与泌尿外科实验室分别于2009年和2010年批准为福建省移植生物学重点实验室、福建省干细胞应用工程技术研究中心，全军器官重建与组织修复重点实验室。具备各种技术准入资质。近5年承担国家及省部级科研课题：21项，主编专著9部、副主编2部、主译2部、参编17部。在国内外学术期刊共发表论著616篇，其中英文及SCI论著72篇，影响因子最高：30.011分。获得包括国家科技进步二等奖、全军科技进步一等奖和福建省科技进步一等奖等科研成果：总计52项。经国家新闻出版总署批准，出版专业学术期刊:《中华细胞与干细胞杂志》。
专科特色：
泌尿外科由泌尿外科病房、干细胞治疗中心病房、肾移植监护室、腔道微创手术室、碎石室、尿动力检查室、实验室等几部分组成。
拥有先进的泌尿外科微创手术设备，可进行各类腹腔镜、经皮肾镜、输尿管镜、膀胱镜、尿道镜等途径进行微创手术，能完成钬激光碎石、气压弹道碎石、各种经尿道的电切、冷刀内切开等腔内手术。具有尿流动力学检查和体外震波碎石设备。擅长肾上腺、肾脏、膀胱、前列腺尿道和小儿泌尿等先天性疑难疾病诊治。具备肿瘤细胞治疗技术资质，并在肾细胞癌免疫细胞治疗方面具有特色。
