西南医院普通外科前身是国民政府中央医院外科，成立于1930年。目前是集医疗、科研和人才培养为一体的国内知名的普通外科之一。现编制床位86张，为博士学位授权学科、国家重点学科、重庆市医学重点学科。现有微创胃肠外科中心、肿瘤生物治疗研究中心、微创疝修补诊疗中心、肛肠疾病诊疗中心。拥有专业技术人员45人，其中高级职称9人，博士生12名，硕士生10名。拥有国内一流的先进设备，包括多功能数字化腹腔镜及超声手术系统、Trivex大隐静脉微创治疗系统、肛肠综合治疗仪、流式细胞仪等。常年设有著名专家门诊和专科门诊，每年门急诊量在36000人次以上，年收治病人在5000人次以上，年手术量在3000台次以上，治疗质量高，并发症少，疗效居国内先进水平。
目前承担有国家、军队及重庆市科研课题多项，先后获国家科技进步二等奖1项、军队科技进步一等奖1项、重庆市科技进步二等奖1项、军队科技进步三等奖5项、国家发明专利3项。
现为中华医学会全国普外专委会胃肠外科学组委员、全军胃肠外科学组委员、全军腹腔镜与内镜外科学组委员、全军肛肠外科学组委员、全军营养支持学组委员、全军血管外科学组委员、全军战创伤专委会胸腹伤组委员；中国抗癌协会理事、全国胃癌专委会委员、全国大肠癌专委会委员、重庆市抗癌协会常务理事、重庆市肿瘤生物治疗专委员会主任委员、重庆市胃癌专委会副主任委员、重庆大肠癌专委会副主任委员；重庆医学会重庆市普通外科学组副主任委员、重庆市营养支持学组主任委员、重庆市胃肠外科学组副主任委员、重庆市腹腔镜与内镜外科学组副主任委员、重庆市肛肠外科学组副主任委员等单位。
现为《中华外科杂志》、《中华胃肠外科杂志》、《中华消化外科杂志》、《中国实用外科杂志》、《中国微创外科杂志》、《中国普外基础与临床杂志》、《外科理论与实践》、《中国临床康复》、《重庆医学》、《第三军医大学学报》、《重庆医学》、《局解手术学杂志》等杂志编委。
