西南医院血液病中心是一所集医疗、教学、科研于一体的综合性学科。学科经过多年的发展，现已成为西南地区最大的血液疾病专科治疗基地之一，综合技术水平居全国先进行列。1978年获批硕士学位授权学科，1986年获批博士学位授权学科及博士后流动站。2006年内科学血液病学获批重庆市重点学科。2007年获批第三军医大学西南医院血液病中心。2007年获批国家卫生部非血缘造血干细胞移植移植医院和非血缘造血干细胞采集医院。2010年与重庆市红十字会联合成立重庆市儿童白血病诊断与治疗中心。
目前年门诊量人超过17000次，年收治病人超过3000例，年骨髓涂片检查超过6000例，处于重庆地区领先水平，并且逐年提高。近几年恶性血液病病例收治数量大幅度提高，白血病和淋巴瘤成为中心的主要收治病例。每年收治各类白血病病例超过600余人次，恶性淋巴瘤超过400余人次。在“白血病的诊断与治疗”和“恶性淋巴瘤”治疗研究方面优势凸显；开展的对血液系统肿瘤及红细胞疾病、白细胞疾病、出凝血性疾病的综合治疗，位于国内先进水平。1996年在川东地区率先实施外周血造血干细胞移植、异基因骨髓移植。造血干细胞移植水平 在国内处于领先水平。实验室建设全面完善，实验诊断达到国内先进水平。医疗质量及护理满意度在全院名列前矛。
近年来承担了干细胞及白血病相关的国家自然科学基金课题及重庆市重点课题等33项。获军队科技进步二等奖1项，获军队科技进步三等奖1项，重庆市科技进步一等奖1项。发表论文400余篇，SCI论文24篇，其中最高影响因子（17.793）。获国家专利5项，学校临床新技术二等奖1项。 近5年来已开展临床新业务、新技术30余项。 血液病中心目前共有工作人员65人。医疗系列21人，高职称4人，中级职称5人, 初级12人，其中博士研究生导师1人、硕士研究生导师3人、博士后1人、博士7人、硕士6人。实验室5人。护理系列39人，主管护师1人，护师9人。 血液病中心使用面积4000M2，床位100张，无菌层流病房10间，拥有单人间、双人间、多人间和VIP病房，每间病房均配备液晶超薄彩电、直拨电话、宽带网、呼叫和对讲系统、中央空调、中央供氧、中央吸引和独立卫生间等设施。分5个区域，一楼为血液病实验中心和办公区，二楼为A病区和VIP病区，三楼为B病区，四楼为全封闭式无菌层流病房。
