科室在2002年被批准为博士学位授权学科。科室在短短的几年多时间里，先后开展了经纤支镜代胸腔镜医用OB胶治疗顽固性气胸、利用Bard针经皮肺穿刺活检术、经纤支镜高频电凝术、胸膜刷检术、放射性气管支架安置术、I125粒子植入术、气道球囊扩张术治疗各种气道狭窄等多项国内较为先进的临床诊疗技术，大大拓展了呼吸系统疾病的诊治领域，进一步巩固了呼吸科在西南地区领先地位。在基础研究领域，也得到了较大的进步：在肺癌研究方面，开展了肺癌耐药相关基因、耐药与染色体畸变关系的研究、姜黄素抗肺癌血管生成的研究、成功利用噬菌体抗体库技术筛选出人源性的抗CEA单克隆抗体；在COPD方面，对慢阻肺患者膈肌疲劳基础与临床进行了详实的研究，并自行成功研制出变频膈肌起搏治疗仪，取得了良好的临床效益；在肺间质纤维化方面，对肺纤维化的发病机制及治疗进行了初步探讨，并首先发现三七总甙在肺纤维化的治疗意义，具有良好的应用前景。
