１９３８年，日军对冀中腹地的侵略步步逼紧。焦建国带领抗日军民，一面加紧练兵，一面实地“清底”，改造旧政府，清查亲日派和反共反人民的土豪劣绅。这一天，焦建国披着满身尘土从练兵场回来，刚坐下喘口气，县委保卫科长焦玉群就风风火火地闯了进来。
“西关出现反动标语！”
标语都是攻击共产党、宣扬“中日亲善”的反动内容。日军的侵略暴行，激起了广大军民的无比愤恨和抗日到底的决心，但也有一些人被敌人的气势汹汹所吓倒，立场动摇。更有少数地痞流氓、反动分子认为时机来临，也蠢蠢欲动，企图为虎作伥。
焦建国当即指示：“迅速清查，严厉镇压。”
带头进行反动活动的家伙很快查清了。此人名叫甄会辰，旧政府留用人员，国民党员，先前伪装积极，潜伏下来，如今眼看敌人步步逼近，狐狸尾巴终于暴露。他仗着儿子在伪军中当大队长，暗中串连一帮狐朋狗党糊膏药旗，写反动标语，准备“欢迎”日本人。
焦建国命人把甄会辰等几个证据确凿的反动分子抓起来，随后召开了各人民团体和群众参加的联合抗日动员大会。
会场上人山人海，群情激愤。甄会辰等人被五花大绑押到会上，焦建国大声说道：“同志们，日寇虽然来势凶猛，占领了我们许多地方，但中华民族不会亡，中国人民不会甘心受辱。在共产党的倡导下，国共合作，抗日统一战线形成，抗日正取得节节胜利，最后胜利一定属于人民。一些民族败类妄图卖国求荣，只能自取灭亡。”
“打倒帝国主义！”“枪毙卖国贼！”“抗日必胜！”震耳的口号声像大海的浪潮，席卷了整个会场。
“把甄会辰等反动分子押下去，交给人民审判！”动员大会变成了声讨日寇侵略暴行的大会，极大地打击了反动分子的嚣张气焰，也极大地鼓舞了抗日军民的抗日斗志。
为了迎击日军，焦建国带领部队和群众日夜苦干，利用原有的旧城墙修筑了工事。县城以及各村之间，都用半人多深、五尺多宽的交通沟相连，沟两边相隔不远就有掩体，既能打，又能藏，还能走人；发动各村制造出大量各式各样的土地雷和土枪土炮；还帮助老百姓挖地道、埋粮食，坚壁清野。由于抗日工作开展得好，饶阳县委被冀中区誉为抗日模范县，多次受到上级的表扬，《冀中抗敌报》还专门介绍过他们的事迹。冀中区党委医院、兵工厂、书店等单位，陆续迁到饶阳一带，这里真正成了冀中抗日根据地可靠的大后方。
１９３８年５月，焦建国受上级党委派遣进驻中共献县县委，同年１０月任中共献县县委书记。１９３８年底，上级调焦建国担任献县、青县、沧县及交河（今泊头市）一带的献青沧交中心县县委书记，加强津浦线两侧的抗日工作。面对这里党组织薄弱、群众基础差、环境残酷等困难条件，焦建国抓紧党团组织建设和各种抗日团体的建设，组织起冀中区人民抗日自卫军十八大队，兼任政委。抗日烽火很快在献、青、沧、交一带熊熊燃烧起来，拆铁路、截火车、炸碉堡，闹得日伪寝食不安。
１９４０年初春，焦建国和青救会主任及交通员王治去开展党的工作，露宿在野洼地里。初春的夜晚，加之白天下了一场大雪，寒气袭人，东北风夹着雪花打在他们的脸上，像刀割一样疼痛。白天他们在战斗中把棉衣都扔掉了，身穿单衣，伙盖着一条破棉被，睡在半泥半雪的野地里。青救会主任和王治提议让焦建国睡在他们俩中间，焦建国坚决不同意，并信心十足地说：“我在监狱里锻炼出来了，风再大，天再冷，我也不怕。”一定要睡在他俩的北面挡风。半夜的时候，青救会主任悄悄地躺在了焦建国的北面，可等第二天清晨在朦胧中醒来后，发现焦建国还是睡在他的北面。当时，他们三人冻得浑身已经麻木、嘴唇发紫、舌头发硬，话都说不出来了，他俩看着老领导焦建国，眼里流下了激动的泪水。
１９４０年５月，转眼麦熟就要到了，为了保护麦收，打击日伪军，焦建国组织开展护麦斗争。在一个漆黑的夜晚，焦建国在丰尔庄村召集了四县有关干部会议，并布置了护麦的具体工作。１９４１年初，日军在滏阳河和津浦铁路集结大量兵力，对交河、青县、献县等地进行大规模“扫荡”，寻找我抗日武装。焦建国率人民抗日自卫军十八大队，在中共交河县长兼游击大队长于时雨所率交河县游击大队的密切配合下，避实就虚，果断出击，在极其艰苦的斗争中取得反“扫荡”的胜利，巩固了交河、青县、献县等地抗日根据地，使抗日斗争的烽火很快在中心县一带熊熊燃烧起来。