核材料“不见天日”
在核武器销毁工程中，最为困难、最为危险、也最为复杂和麻烦的就是对核弹头的销毁。因为核弹头中有大量放射性极强的核装料，其核装药TNT当量往往从几万吨到几百万吨级。这些核装料浓度极高，一旦不慎泄漏出去，会对人员、生物和环境造成极大危害。所以，销毁核弹头一点也不比制造简单。
正因为如此，连美苏《中导条约》都没有对弹头核装置如何处理作出具体规定。该条约虽然要求导弹在运往销毁场地之前，应将弹头内的核装置拆下，但对于拆除下来的核装置如何处理，则没有明确，只是说可以作为能源和燃料加以和平利用。这虽然是《中导条约》的一个明显缺陷，但从另一个侧面说明了核装置的销毁工作难度之大、危险之高。
实际上，核装料的销毁，主要采用深埋法。将核弹头上的钚或铀，氧化、改造后与其他放射性废料混合，并固化在具有防辐射特性的玻璃、陶瓷、金属或水泥桶里，置放于一个特殊的大固化陶瓷罐内，然后放入巨大的高密度钢盒中，深埋地下，使之永远“不见天日”。
为确保运输和贮存的安全，还要在这些放射物中加入黏结剂和催化剂，使更加固化。运输时，通常用采取了屏蔽措施的同位素车运往指定地域，将核装料深埋在地下深处，使之与生物界隔离至少300年以上。或者将其投放在水文和地质稳定的深海之中，以防止某些国家或组织获得核弹头里面的核原料后,用于制造本国或本组织的核武器。
由于销毁过程中会产生很多有毒物质,这些物质易溶于水,一旦进入土壤,这种毒性就会长时间保留。处理不好,就会造成类似切尔诺贝利核事故后那样的核污染灾难，后果不堪设想。回想起日本福岛核电站那场灾难，那种恐慌、那片阴影还依旧笼罩在人们心头。
因此，销毁核装料时，必须选择好深埋的地点。深埋点地址的选择必须充分考虑地理、气象、水文、居民分布、生态环境、区域经济发展水平等因素。通常应选在地质稳定、水位较低、地理条件好、人烟稀少、交通不便的地方。
仅从地质条件上讲，最好选在硬质岩石深埋之处，不能有切割地壳的深断层，其地震烈度一般不宜超过7度。向深海投放销毁的核装料时，水深一般大于4000米。例如，英国、法国就曾向西班牙海和爱尔兰海投放了许多固化的核废物。
核武器“变废为宝”
销毁核武器并非将核武器的所有材料完全毁灭，这是因为核武器的许多材料还大有和平利用的价值。
待销毁的导弹、飞机、潜艇等运载工具或发射设施，以及包裹核弹头壳体中都使用了大量的贵重金属，其强度极大，利用价值也非常高，通常要取下来用于其他领域。
为此，美俄两国专家都曾提出了可供利用的清单和方法。导弹的自动控制系统，控制精度很高，而且全部实现了自动化，可以将其“和平改装”为蔬菜仓库和汽车库的恒温系统，或改为供水设备，让其在民用领域发挥作用。发射导弹的平台和塔架，高达十几米甚至几十米，可改装成起重机，作为巨型起重设备。
苏联就曾同联邦德国一起，将SS-20导弹发射架改为6轮轴起重机，使导弹的可利用部分变成了具有特殊价值的民用商品。
即使是核装料，也并非一钱不值。据报道，美国在得克萨斯州的潘特克斯工厂(属能源部)拆除潘兴-2导弹和陆基巡航导弹的弹头核装置，共回收2吨钚和4吨浓缩铀，这是一批可观的核燃料。
为此，美国采取了“变废为宝”的技术措施，将钚处理后，变成氧化钚。同时，将铀经过特殊处理后变成低浓度铀，并制成燃烧组件运往核电站，作为轻水核反应堆的燃料，达到发电的目的。
然而，无论是直接销毁核武器，还是对核武器部分材料进行再利用，都需要花费巨额资金。相关的数据可以说明这一点：2010年4月，美俄两国签订了进一步削减核武器的协议。根据这一协议，俄美两国将分别销毁(包括再利用)各自国家34公吨的钚。为实施该计划，美国将花掉4亿美元，而俄罗斯由于销毁数量和处理方法的不同，预计将花费35亿美元。
