蒙古准噶尔部首领噶尔丹自乌兰布通之战败归后，在科布多重整旧部，又从沙俄处购买枪炮，经过几年经营，逐渐恢复元气。康熙三十四年（1695年），噶尔丹再次发兵2万攻打喀尔喀蒙古，随后沿克鲁伦河一路东犯，进抵巴颜乌兰（今蒙古国温都尔汗西）。当年11月，康熙决定再次亲征讨伐，彻底解决漠西蒙古之患。

千里寻敌

按照康熙的进军计划，清军一共兵分3路：黑龙江将军萨布素率东路军9000人，出兴安岭沿克鲁伦河西进，堵住准噶尔军东进道路；抚远大将军费扬古、振武将军孙思克率西路军4.6万人，分别自归化（今内蒙古呼和浩特）、宁夏等地出兵，沿翁金河北上断其退路；康熙亲率中路军3.4万人，出独石口（今河北沽源南），经克鲁伦河上游北上，与东西两路军夹击噶尔丹军。

康熙三十五年（1696年）2月28日起，清军各路人马依次启程。由于战线广阔、出兵地点分散，西路军费扬古部和孙思克部相约会师于翁金（今蒙古国海尔汗都兰），东、中两路大军约在土喇（今蒙古国乌兰巴托西南）会合后等待，然后再相机而动。面对清军声势浩大的进攻，噶尔丹一面沿克鲁伦河西撤，一面将沿途青草尽焚，试图阻挠清军行军。这一办法果然奏效，西路军孙思克部2万余人出发后，一路气候恶劣、水草匮乏，4月11日到达翁金时，已经失期数日。费扬古遂改变计划，从孙思克军中挑选4千精兵随行，其余皆留下守粮或后续跟进。康熙得西路军奏报后，为防止孤军对敌，只得令中路军缓行以待。5月8日，中路军进抵克鲁伦河的准噶尔军大营时，发现噶尔丹已于前一日弃营西逃。康熙发轻骑兵追击数日后，因其随军携带口粮消耗殆尽，只得下令班师。眼看此次出征就要徒劳无功之时，西路军传来好消息，轻兵而行的费扬古部兼程并进，终于在5月13日赶至昭莫多（今蒙古国乌兰巴托南），将狂奔5日的噶尔丹截住。至此，本次大战演变为噶尔丹同费扬古西路军的对决。

反客为主

战役开始前，两军状况都不容乐观。费扬古的西路军掉队严重，赶到昭莫多的只有1.4万人。噶尔丹为摆脱清军追击，沿途也抛弃了大量伤员和辎重，双方在昭莫多战场的兵力相当。为争取主动，费扬古先发兵抢占了昭莫多以北的山岭，而后将全军一分为三：以一部依山列阵于东，一部沿山下的土喇河布防于西，孙思克率步兵居中，扼守山顶。按照康熙战前所授方略，所有骑兵下马步战，待冲锋时再上马出击。

一切布置停当后，费扬古命前锋硕岱率骑兵数百名，接敌后且战且退，将敌一路引至昭莫多山下。噶尔丹见山上人马不多，以为西路清军孱弱，便集中全力进攻清军控制的山头。因地形条件所限，准噶尔军也舍马步战，噶尔丹与其妻阿努亲自带头冲锋，攻势甚锐。然而，山地攻坚作战，乃是清军所长，激战半日，准噶尔军未能冲破战阵。此时，费扬古见准噶尔军主力已被孙思克的步兵牵制住，其后方的辎重部队又缺乏保护，便及时调整部署，以骑兵一部偷袭其辎重部队，一部横冲入阵，据守山头的孙思克部也乘机出击，噶尔丹腹背受敌，全军崩溃瓦解，其妻阿努被火枪打死。清军趁夜追杀30里，至特勒尔济口方收兵，一路斩杀3000余人，收降千余人，俘获牲畜6万余头，噶尔丹仅率数十骑逃走。回到科布多后，噶尔丹众叛亲离，一蹶不振。在清军强大攻势的逼迫之下，于次年5月3日服毒身亡。

用兵得失

昭莫多之战前，噶尔丹汲取了乌兰布通失利的教训，竭力避免与清军主力会战。他采取了通过袭扰调动，用运动战消耗清廷国力，并伺机歼其一部的战法。从战役前期的发展态势看，这一方针得到了较好的贯彻执行。在噶尔丹的多次调动下，清军3路大军9万人中，仅费扬古部赶到战场，且饱受长途行军之苦，战斗力大减。因此在昭莫多这一局部战场，准噶尔军的兵力劣势不大，且相对具有以逸待劳的优势。不过，在具体的战术应用上，噶尔丹频频犯错：先是因为轻敌进入了费扬古预设的主战场，将攻守之势轻易让人；战斗发起后，又舍弃己方骑兵的优势，改为下马步战，同清军在山地短兵相接，可谓是以短击长；在兵力布置上，将全部兵力投入攻山战斗，没有留出必要的预备队，最终在清军的前后夹击下失败。

清军战前的准备非常充分。不仅针对准噶尔军的战术特点，给参战部队增发大批火枪，征召众多蒙古向导，携带大量树枝、木材用以通过河流和沼泽地带，还为每名士兵配备1名民夫和4匹战马，随军携带5个月口粮，另有数万峰骆驼和7000辆大车运送粮食给养。虽然在深入漠北腹地数千里后出现局部断粮的情况，但总体完成了保障任务，确保了全军组织有序、进退得当。这其中，费扬古的表现尤其值得称赞。他先是因时用兵，果断地将全军精锐和粮草集中，采取轻兵锐进的战术，攻击准噶尔军要害，抓住了稍纵即逝的战机。面对敌锐我疲的情况，他能主动示弱，将对方引入自己精心布置的战场，并逼迫其放弃骑兵优势进行山地攻坚，可谓经典的“反客为主”。在具体的兵力布置上，清军奇正并用、步骑呼应，关键时刻出动骑兵袭其辎重，一举打破僵局。